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  1. README.md +3 -3
README.md CHANGED
@@ -20,7 +20,7 @@ Zhang et al. 2023 의 GPS peptidome 스크린(Table S2) 28-mer 펩타이드 **25
20
 
21
  | 폴더 | 모델 | 레이어 | 차원 | 레이어당 | 합계 |
22
  |---|---|---|---|---|---|
23
- | `ESM2_8M/` | [`facebook/esm2_t6_8M_UR50D`](https://huggingface.co/facebook/esm2_t6_8M_UR50D) | 8 | 320 | 4.5 GB | 36.1 GB |
24
 
25
  **레이어 1개 = 파일 1개** 입니다. 모든 펩타이드가 28잔기로 길이가 같아서 `(N, 30, dim)` 통짜 배열로 쌓았습니다. 펩타이드가 25만 개라 개별 파일로 만들면 HF 권장치(폴더당 1만)를 크게 넘습니다.
26
 
@@ -118,7 +118,7 @@ for tr, te in gkf.split(X, y, groups=z['uniprot_acc']):
118
  import numpy as np
119
  from huggingface_hub import hf_hub_download
120
 
121
- p = hf_hub_download("Limtat99/zhang2023-internal252502-emb", "ESM2_8M/L0.npz",
122
  repo_type="dataset")
123
  z = np.load(p)
124
  X = z["embedding"] # (N, 30, dim) float16
@@ -137,7 +137,7 @@ npz 는 zip 이라 seek 가 되면 필요한 멤버만 읽힙니다.
137
  ```python
138
  from huggingface_hub import HfFileSystem
139
  fs = HfFileSystem()
140
- with fs.open("datasets/Limtat99/zhang2023-internal252502-emb/ESM2_8M/L0.npz", "rb") as f:
141
  y = np.load(f)["control_psi"] # 라벨만 = 몇 MB 만 전송
142
  ```
143
 
 
20
 
21
  | 폴더 | 모델 | 레이어 | 차원 | 레이어당 | 합계 |
22
  |---|---|---|---|---|---|
23
+ | `ESM2_650M/` | [`facebook/esm2_t33_650M_UR50D`](https://huggingface.co/facebook/esm2_t33_650M_UR50D) | 35 | 1280 | 18.1 GB | 632.1 GB |
24
 
25
  **레이어 1개 = 파일 1개** 입니다. 모든 펩타이드가 28잔기로 길이가 같아서 `(N, 30, dim)` 통짜 배열로 쌓았습니다. 펩타이드가 25만 개라 개별 파일로 만들면 HF 권장치(폴더당 1만)를 크게 넘습니다.
26
 
 
118
  import numpy as np
119
  from huggingface_hub import hf_hub_download
120
 
121
+ p = hf_hub_download("Limtat99/zhang2023-internal252502-emb", "ESM2_650M/L0.npz",
122
  repo_type="dataset")
123
  z = np.load(p)
124
  X = z["embedding"] # (N, 30, dim) float16
 
137
  ```python
138
  from huggingface_hub import HfFileSystem
139
  fs = HfFileSystem()
140
+ with fs.open("datasets/Limtat99/zhang2023-internal252502-emb/ESM2_650M/L0.npz", "rb") as f:
141
  y = np.load(f)["control_psi"] # 라벨만 = 몇 MB 만 전송
142
  ```
143