Milad96 commited on
Commit
9f1c5a2
·
verified ·
1 Parent(s): 60ab142

Upload README_CELL5.md with huggingface_hub

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. README_CELL5.md +10 -10
README_CELL5.md CHANGED
@@ -9,21 +9,21 @@ tags:
9
 
10
  # 🌌 Cell 5: Quantum Metabolomics & Compounds
11
 
12
- این README داده‌های جمع‌آوری‌شده توسط **Cell 5** را مستند می‌کند، که در پیکربندی `cell5_metabolomics` اجرا می‌شود و از پیکربندی `default` سلول‌های ۱-۴ مجزا است.
13
 
14
- این مجموعه داده از یک **اسکیمای توسعه‌یافته** (۴۹ فیلد) برای گنجاندن ویژگی‌های شیمیایی دقیق استفاده می‌کند.
15
 
16
  ## Statistics
17
  - **Version**: v10.0.0
18
  - **Total Records (All Runs)**: 417
19
- - **RDKit Enabled (This Run)**: ⚠️ No
20
  - **Last Updated**: 2025-11-12
21
 
22
  ## Data Access
23
 
24
- داده‌ها به داده‌های خام و اسپلیت‌های train/val/test تقسیم شده‌اند.
25
 
26
- ### ۱. بارگیری تمام داده‌های خام (توصیه می‌شود)
27
  ```python
28
  from datasets import load_dataset
29
  dataset = load_dataset(
@@ -35,7 +35,7 @@ dataset = load_dataset(
35
  # (dataset contains 417 records)
36
  ```
37
 
38
- ### ۲. بارگیری اسپلیت‌ها
39
  ```python
40
  from datasets import load_dataset
41
  splits = load_dataset(
@@ -49,10 +49,10 @@ splits = load_dataset(
49
  ## Data Sources (All Runs)
50
  | Collector Source | Category | Records |
51
  | :--- | :--- | ---: |
52
- | chembl | unknown | 338 |
53
- | uniprot | unknown | 70 |
54
- | kegg | unknown | 7 |
55
- | bigg | unknown | 2 |
56
 
57
  ## Schema
58
  This dataset uses an **Extended Schema** with 49 fields, including `cid`, `inchikey`, `canonical_smiles`, `molecular_weight`, etc.
 
9
 
10
  # 🌌 Cell 5: Quantum Metabolomics & Compounds
11
 
12
+ This README documents the data collected by **Cell 5**, which runs in the isolated `cell5_metabolomics` config to prevent schema conflicts with Cells 1-4.
13
 
14
+ This dataset uses an **Extended Schema** (49 fields) to include detailed chemical properties.
15
 
16
  ## Statistics
17
  - **Version**: v10.0.0
18
  - **Total Records (All Runs)**: 417
19
+ - **RDKit Enabled (Last Run)**: ⚠️ No
20
  - **Last Updated**: 2025-11-12
21
 
22
  ## Data Access
23
 
24
+ Data is separated into raw data (one 'train' split) and processed splits (train/val/test).
25
 
26
+ ### 1. Load All Raw Data (Recommended)
27
  ```python
28
  from datasets import load_dataset
29
  dataset = load_dataset(
 
35
  # (dataset contains 417 records)
36
  ```
37
 
38
+ ### 2. Load Processed Splits
39
  ```python
40
  from datasets import load_dataset
41
  splits = load_dataset(
 
49
  ## Data Sources (All Runs)
50
  | Collector Source | Category | Records |
51
  | :--- | :--- | ---: |
52
+ | chembl | compound | 338 |
53
+ | uniprot | enzyme | 70 |
54
+ | kegg | compound | 7 |
55
+ | bigg | metabolic_model | 2 |
56
 
57
  ## Schema
58
  This dataset uses an **Extended Schema** with 49 fields, including `cid`, `inchikey`, `canonical_smiles`, `molecular_weight`, etc.