text: 单细胞热门思路方向集锦——眼科篇
  眼睛是心灵的窗户，也是视觉的感觉器官，包括眼球及其附属器。眼所占的体表面积和容积虽小，但其功能对生活和劳动至关重要。眼是机体的一个组成部分，许多全身系统性疾病可在眼部有所表现。为“捕捉”光的讯息，眼必须暴露于体表，这增加了它受外伤和外界病原体侵袭的机会。眼的疾病最终都会影响视觉功能。视力丧失不但使患者遭受痛苦，也会给家庭和社会带来不幸，因此眼科学的研究有重大意义。单细胞测序技术可以在单细胞分辨率上获得细胞内基因表达信息，在揭示细胞异质性方面具有极大优势，被广泛应用于发育生物学、肿瘤、神经科学、免疫、微生物等各个领域。单细胞测序技术在眼科研究中有着非常广阔的前景，目前主要应用于角膜和视网膜的研究，在细胞图谱的构建、细胞新亚型的识别、疾病发生发展过程中的病理机制及异质性研究以及相关疾病的诊断和潜在的治疗中均有新的进展，接下来随小派一起看一下目前眼科领域相关单细胞研究领域和思路有哪些？
  文献案例1
  A single-cell transcriptome atlas of the adult human retina
  中文题目：单细胞转录组学绘制成人视网膜细胞图谱
  发表期刊：The EMBO Journal
  视网膜是一种特殊的神经组织，负责感知光线并启动图像处理。虽然已经对特定视网膜细胞的功能组织进行了很好的研究，但在人类中，许多细胞类型的分子图谱仍然不清楚。
  取3位捐赠者的视网膜样本
  主要结论
  该研究利用单细胞转录组测序技术，在单细胞水平上构建了成人视网膜的转录组图谱，鉴定了所有主要人类视网膜细胞类型，包括：视杆细胞、视锥细胞、穆勒胶质细胞、视网膜星形胶质细胞、小胶质细胞、双极细胞、神经节细胞、无长突细胞和水平细胞），此外，本研究还揭示了MALAT1的表达随死后时间的延长而丢失，表明MALAT1在杆状感光器退化中起着新的作用，为视网膜相关疾病的研究提供理论基础。
  Cell atlas of aqueous humor outflow pathways in eyes of humans and four model species provides insight into glaucoma pathogenesis
  中文题目：单细胞测序描绘房水流出通道的细胞图谱
  发表期刊：PNAS
  青光眼作为导致人类失明的三大致盲眼病之一，属于神经退行性疾病，然而由于发病隐匿，早期自觉症状不明显，所以不易引起患者的警觉。它是由视网膜神经节细胞(RGCs)的缺失导致的，致病的危险因素包括年龄、种族和家族史，而唯一可改变的是眼压(IOP)。目前降低眼压是唯一被证明有效的治疗手段。但由于对组织如何控制IOP和IOP升高导致RGC损失的机制不甚了解，因此治疗的研究进展受到一定限制。（房水是由睫状体产生，经前房循环，然后通过小梁网途径或者葡萄膜巩膜途径排出）。
  从6名死后供体7只眼中分离的成人小梁网（TM）和周围组织获得单细胞，眼压调节机制的分析和治疗干预的临床前研究几乎完全依赖于动物模型，故本研究选取从恒河猴、食蟹猴、野猪和小鼠的视网膜前端组织获取单细胞。
  该研究构建了小梁网及其周围结构的单细胞图谱，这些结构构成了人类和四种模型动物的房水流出通道，确定了每种细胞类型的标记物，深入研究了这种复杂组织的各个组成部分，并揭示了一些特征，如免疫环境和小梁网流出途径的特征。该研究还为全基因组关联研究中确定的易感位点提供了生物学背景。以上结果可以指导人类和动物模型青光眼的进一步探索。
  中文题目：单细胞转录组测序描绘甲状腺相关眼病的眼眶组织免疫微环境
  发表期刊：Cell reports medicine
  甲状腺相关性眼病（TAO）是以眼球后及眶周组织的浸润性病变为特征的器官特异自身免疫性疾病，是甲状腺疾病最常见的甲状腺外表现之一。TAO常表现为突眼、眼睑退缩、复视等，严重者甚至会危及视力，导致失明。目于对其发病机制知之甚少，TAO的治疗仍然具有挑战性，因此，深入解析TAO眼眶结缔组织的免疫微环境，有望为进一步阐明TAO发病机制和找到潜在的治疗靶点提供分子依据。
  取10名接受眶减压手术的TAO患者与10名接受眼睑整形术的正常对照的眼眶结缔组织进行单细胞转录测序。
  该研究构建了甲状腺相关性眼病（TAO）眼眶结缔组织的单细胞图谱，发现表达RASD1的脂肪成纤维细胞高度参与脂肪生成和炎症，ACKR1 +内皮细胞有助于 TAO 中的炎症细胞浸润，脂肪组织巨噬细胞参与 TAO 中的脂质代谢和炎症反应。通过对TAO眼眶组织免疫微环境的进一步认识，为探索TAO的潜在治疗靶点提供了新的思路。
  [1]Lukowski S W , Lo C Y , Sharov A A , et al. A single‐cell transcriptome atlas of the adult human retina[J]. The EMBO Journal, 2019, 38(18).
  [2]Tavé van Zyl, Yan W , Mcadams A ,et al.Cell atlas of aqueous humor outflow pathways in eyes of humans and four model species provides insight into glaucoma pathogenesis[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117(19):10339-10349[2023-07-13].DOI:10.1073/pnas.2001250117.